Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms