Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rft1Q8C3B8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rft1Q8C3B8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms