Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms