Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV6

Lsm11, U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm11Q8BUV6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lsm11Q8BUV6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms