Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.4 ms