Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpc2Q8BKV1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms