Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms