Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms