Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms