Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms