Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms