Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ell3Q80VR2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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