Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rexo1Q7TT28 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo1Q7TT28 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms