Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Clec18aQ7TSQ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Clec18aQ7TSQ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Clec18aQ7TSQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Clec18aQ7TSQ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Clec18aQ7TSQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Clec18aQ7TSQ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Clec18aQ7TSQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms