Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcdh8Q7TSK3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdh8Q7TSK3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms