Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms