Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1cQ7TSF0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms