Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms