Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL7

Dusp9, Dual specificity protein phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp9Q7TNL7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp9Q7TNL7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp9Q7TNL7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms