Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SyncripQ7TMK9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms