Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eci3Q78JN3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eci3Q78JN3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms