Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Ncapd3Q6ZQK0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms