Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms