Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms