Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab35Q6PHN9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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