Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trak1Q6PD31 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trak1Q6PD31 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms