Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC061212Q6P8K3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC061212Q6P8K3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms