Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam222bQ6P539 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms