Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg2f1Q6P3A2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frg2f1Q6P3A2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms