Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frem2Q6NVD0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms