Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ltv1Q6NSQ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ltv1Q6NSQ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms