Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms