Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd6Q69ZL1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms