Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brsk2Q69Z98 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brsk2Q69Z98 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms