Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms