Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms