Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms