Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TsnQ62348 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms