Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr2Q62312 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr2Q62312 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms