Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ss18Q62280 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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