Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SypQ62277 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SypQ62277 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SypQ62277 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SypQ62277 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SypQ62277 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SypQ62277 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SypQ62277 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SypQ62277 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SypQ62277 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms