Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms