Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Sema3cQ62181 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Sema3cQ62181 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3cQ62181 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sema3cQ62181 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sema3cQ62181 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3cQ62181 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3cQ62181 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3cQ62181 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3cQ62181 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3cQ62181 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms