Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf1Q61999 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms