Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms