Protein–RNA interactions for Protein: Q61704

Itih3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih3Q61704 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itih3Q61704 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itih3Q61704 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms