Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HlxQ61670 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HlxQ61670 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HlxQ61670 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms