Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms