Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ecm1Q61508 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm1Q61508 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms