Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AcanQ61282 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms